36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0673 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0673  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 303 aa  564  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  42.91 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  38.99 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  41.52 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  40.51 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  37.5 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  36.03 
 
 		 304 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  36.88 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  36.88 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  33.44 
 
 		 304 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  41.07 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  34.98 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  32.14 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  34.38 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1225  Type II secretion system F domain protein  38.71 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467783 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  32.4 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  32.43 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  32.66 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3132  type II secretion system protein  37.63 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8597  type II secretion system protein  31.68 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0722577  normal  0.464587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3330  type II secretion system protein  30.9 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0799285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  31.91 
 
 		 314 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  28.76 
 
 		 311 aa  49.7  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  24.89 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  30.46 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  30 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  32 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1402  hypothetical protein  31.58 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.892994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  24.89 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  29.22 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  25.15 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1649  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.2409  hitchhiker  0.00110779 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7218  type II secretion system protein  23.57 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.329226 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5619  type II secretion system protein  23.57 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  24.75 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>