26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6892 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  100 
 
 		 297 aa  568  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  37.25 
 
 		 301 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  36.79 
 
 		 301 aa  145  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  36.82 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  34.19 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  36.52 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  32.54 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8597  type II secretion system protein  32.77 
 
 		 283 aa  99  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0722577  normal  0.464587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  30.7 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  30.21 
 
 		 288 aa  95.9  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  32.63 
 
 		 301 aa  92.4  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1225  Type II secretion system F domain protein  31.7 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  35.48 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  29.7 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  29.79 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  29.61 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  29.34 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0673  Type II secretion system F domain protein  33 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3132  type II secretion system protein  34.26 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  27.39 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  28.24 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  26.72 
 
 		 294 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  25.95 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3330  type II secretion system protein  31.61 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0799285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  25.17 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>