23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3132 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3132  type II secretion system protein  100 
 
 		 322 aa  603  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  50.64 
 
 		 304 aa  261  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  48.12 
 
 		 311 aa  248  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  47.42 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  35.39 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  37.42 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  41.74 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  34.35 
 
 		 297 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  40.83 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  35.56 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1225  Type II secretion system F domain protein  36.77 
 
 		 297 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467783 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  37.14 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 303 aa  105  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  34.27 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  31.46 
 
 		 301 aa  94.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0673  Type II secretion system F domain protein  35.11 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8597  type II secretion system protein  40.3 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0722577  normal  0.464587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  30.33 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  29.58 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3330  type II secretion system protein  30.91 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0799285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 307 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  24.24 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>