29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4724 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  100 
 
 		 302 aa  597  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  43.89 
 
 		 300 aa  212  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  37.5 
 
 		 304 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  31.37 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  32.57 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  29.47 
 
 		 304 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  37.68 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  32.36 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  29.79 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  29.97 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  30.47 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0673  Type II secretion system F domain protein  32.25 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  29.46 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1225  Type II secretion system F domain protein  40 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467783 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  27.84 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  27.73 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  25.41 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3132  type II secretion system protein  36.26 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3330  type II secretion system protein  31.55 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0799285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8597  type II secretion system protein  37.25 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0722577  normal  0.464587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  28 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  24.83 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  25.71 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  35.59 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  27.41 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  30.25 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  30.07 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  25.29 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>