37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1734 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  100 
 
 		 301 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  95.35 
 
 		 301 aa  520  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  44.93 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  40.6 
 
 		 304 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  38.67 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  37.5 
 
 		 311 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  38.95 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  37.83 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1225  Type II secretion system F domain protein  43.07 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  33.88 
 
 		 303 aa  123  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  33.1 
 
 		 288 aa  122  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0673  Type II secretion system F domain protein  36.88 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8597  type II secretion system protein  38.74 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0722577  normal  0.464587 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  33.79 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3132  type II secretion system protein  41.74 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  34.4 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  33.81 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  33.56 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  35.16 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  30.77 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3330  type II secretion system protein  33.83 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0799285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  25.47 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1362  type II secretion system protein  35.04 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  27.56 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  25.28 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  25.09 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  25.97 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  26.74 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  26.82 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  23.08 
 
 		 287 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  24.58 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  25.15 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  27.71 
 
 		 307 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  23.72 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  24.06 
 
 		 292 aa  42.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>