19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1362 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1362  type II secretion system protein  100 
 
 		 294 aa  543  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3330  type II secretion system protein  46.74 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0799285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  35.09 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  33.78 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  35.1 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  31.67 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  29.61 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  33.14 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  33.12 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  32.18 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  33.83 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  28.12 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  31.54 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  33.12 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  27.68 
 
 		 302 aa  49.3  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  34.04 
 
 		 303 aa  45.8  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  33.08 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0782  Type II secretion system F domain protein  29.37 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00284704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>