39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1543 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  100 
 
 		 300 aa  590  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  45.24 
 
 		 302 aa  208  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  36.58 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  32.89 
 
 		 304 aa  149  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  33.73 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  32.86 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  36.36 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  35.16 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  32.57 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0673  Type II secretion system F domain protein  36.07 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  32.3 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  32.19 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  35.16 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  30.95 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3132  type II secretion system protein  44.75 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  32.42 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  28.83 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1225  Type II secretion system F domain protein  37.25 
 
 		 297 aa  86.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  31.38 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8597  type II secretion system protein  39.26 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0722577  normal  0.464587 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  32.37 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  33.09 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  31.61 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6878  type II secretion system protein  27.91 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465681  normal  0.240753 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  28.47 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  26.81 
 
 		 317 aa  52.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  32.37 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3330  type II secretion system protein  27.46 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0799285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  28.34 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  26.97 
 
 		 311 aa  49.3  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  26.95 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  25.58 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  27.34 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  26.62 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7218  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.329226 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  28.67 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  26.19 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  24.38 
 
 		 321 aa  42.4  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>