30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4646 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  100 
 
 		 305 aa  591  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  38.46 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  37.17 
 
 		 311 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  33.44 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  34.98 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  34.69 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  34.42 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  31.16 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  32.33 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3132  type II secretion system protein  39.45 
 
 		 322 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  32.5 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0673  Type II secretion system F domain protein  32.89 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  28.15 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  31.48 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  30.23 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3330  type II secretion system protein  31.99 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0799285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8597  type II secretion system protein  31.21 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0722577  normal  0.464587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  28.29 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1225  Type II secretion system F domain protein  36.21 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467783 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0074  type II secretion system protein  27.05 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557722  normal  0.8398 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  25.58 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  24 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  23.61 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  23.98 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  18.6 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  23.01 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  26.44 
 
 		 313 aa  42.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>