23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1308 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  599  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  62.58 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  54.02 
 
 		 304 aa  311  6.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3132  type II secretion system protein  48.12 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  38.96 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  37.01 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  37.18 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  37.17 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  38.18 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  31.54 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  33.19 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  31.6 
 
 		 303 aa  105  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  33.2 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  33.62 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  30.41 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  31.1 
 
 		 288 aa  89  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1225  Type II secretion system F domain protein  34.44 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0673  Type II secretion system F domain protein  32.14 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8597  type II secretion system protein  33.85 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0722577  normal  0.464587 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  30.07 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3330  type II secretion system protein  30 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0799285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  28.12 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4394  type II secretion system protein  24.18 
 
 		 314 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>