42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4140 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  100 
 
 		 304 aa  587  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  62.58 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  54.3 
 
 		 304 aa  308  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3132  type II secretion system protein  50.48 
 
 		 322 aa  192  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  38.99 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  41.28 
 
 		 301 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  40.6 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  36.63 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  43.4 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  33.99 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  32.89 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1225  Type II secretion system F domain protein  38.96 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467783 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  39.32 
 
 		 302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  33.56 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  29.72 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  36.73 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0673  Type II secretion system F domain protein  33.55 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  29.24 
 
 		 288 aa  95.9  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8597  type II secretion system protein  35.17 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0722577  normal  0.464587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3330  type II secretion system protein  30.9 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0799285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  24.74 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  26.34 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  28.05 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  26.99 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  30.85 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  25.27 
 
 		 287 aa  49.3  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  26.44 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 288 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  27.01 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  28.98 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  24.57 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 319 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  27.49 
 
 		 643 aa  45.8  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  26.04 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  25.61 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06191  hypothetical protein  23.79 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  24.69 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  23.35 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>