21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4455 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  100 
 
 		 288 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  93.75 
 
 		 288 aa  492  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0673  Type II secretion system F domain protein  42.91 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  34.56 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  35.56 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  39.01 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  33.1 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  30.79 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  34.86 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  31.34 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  32.07 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  31.1 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  28.43 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  35.94 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  35.1 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  32.98 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1225  Type II secretion system F domain protein  31.98 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8597  type II secretion system protein  31.85 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0722577  normal  0.464587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3330  type II secretion system protein  27.64 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0799285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3132  type II secretion system protein  31.93 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0203801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>