21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3330 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3330  type II secretion system protein  100 
 
 		 294 aa  559  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0799285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1362  type II secretion system protein  46.74 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  35.27 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  32.88 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  30.9 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  32.08 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  31.36 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  32.98 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  31.96 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  30 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  26.86 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  27.64 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  27.64 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  28.39 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  28.27 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  27.17 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  28.95 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0673  Type II secretion system F domain protein  29.73 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  25 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0782  Type II secretion system F domain protein  31.71 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00284704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1225  Type II secretion system F domain protein  35.04 
 
 		 297 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>