30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2760 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  586  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  39.87 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  38.96 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  38.64 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  37.83 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  37.83 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  34.53 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  35.68 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  34.6 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  34.42 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  34.46 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3132  type II secretion system protein  42.29 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  29.67 
 
 		 303 aa  95.9  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1225  Type II secretion system F domain protein  40.88 
 
 		 297 aa  95.9  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0673  Type II secretion system F domain protein  34.38 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  31.88 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  29.37 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  35.25 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  36.36 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8597  type II secretion system protein  28.43 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0722577  normal  0.464587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3330  type II secretion system protein  32.98 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0799285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  25.91 
 
 		 288 aa  49.7  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 304 aa  49.3  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  23.28 
 
 		 287 aa  49.3  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03347  hypothetical protein  27.65 
 
 		 187 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  24.48 
 
 		 426 aa  46.6  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  28.87 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  26.8 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  24.73 
 
 		 287 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  23.62 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>