24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2224 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  100 
 
 		 303 aa  604  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  54.67 
 
 		 303 aa  292  5e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  45.67 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  34.56 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  33.99 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  34.45 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0673  Type II secretion system F domain protein  37.5 
 
 		 303 aa  139  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  35.02 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  33.55 
 
 		 301 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  33.78 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  33.88 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  31.6 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  29.67 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  30.81 
 
 		 297 aa  95.9  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  29.49 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 305 aa  85.9  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1225  Type II secretion system F domain protein  30.87 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467783 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  27.73 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8597  type II secretion system protein  32.95 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0722577  normal  0.464587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3132  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3330  type II secretion system protein  28.33 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0799285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  22.27 
 
 		 426 aa  46.6  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0782  Type II secretion system F domain protein  29.08 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00284704  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  23.18 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>