21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8597 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8597  type II secretion system protein  100 
 
 		 283 aa  545  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0722577  normal  0.464587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  41.63 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  37.35 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  36.63 
 
 		 301 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  35.17 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  35.71 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  33.61 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1225  Type II secretion system F domain protein  38.65 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  32.37 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  32.95 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  29.39 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  32.98 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  38.78 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  28.38 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  29.46 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  35.38 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  29.49 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0673  Type II secretion system F domain protein  31.68 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3132  type II secretion system protein  39.71 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  25.15 
 
 		 319 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>