51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4033 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  100 
 
 		 297 aa  560  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  44.26 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  44 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  37.05 
 
 		 304 aa  178  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  37.86 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  38.36 
 
 		 304 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1225  Type II secretion system F domain protein  42.96 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8597  type II secretion system protein  44.13 
 
 		 283 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0722577  normal  0.464587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  34.85 
 
 		 305 aa  132  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  37.22 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  33.55 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  34.27 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  38.84 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3132  type II secretion system protein  41.18 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  31.36 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  35.05 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  34.48 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0673  Type II secretion system F domain protein  37.11 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  29.14 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  28.52 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3330  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0799285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  26.15 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  24.09 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  26.22 
 
 		 426 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  25.61 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  26.16 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 314 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  24.42 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  25.69 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  27.91 
 
 		 319 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1362  type II secretion system protein  33.58 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  24.59 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  24.34 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  26.13 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  25.94 
 
 		 314 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  28.32 
 
 		 306 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  28.32 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  25.56 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  23.67 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  23.98 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  26.37 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  22.99 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  27.07 
 
 		 643 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  24.48 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  22 
 
 		 311 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3492  type II secretion system protein  23.15 
 
 		 313 aa  42.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39955  normal  0.0861426 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  25.29 
 
 		 331 aa  42.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  22.8 
 
 		 295 aa  42.4  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>