23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4968 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  100 
 
 		 288 aa  564  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  93.75 
 
 		 288 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0673  Type II secretion system F domain protein  41.52 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  34.45 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  36.44 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  37.67 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  30.03 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  33.45 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  30.13 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  35.21 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  29.93 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  30.38 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  30.07 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  36.99 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  35.53 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  29.39 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1225  Type II secretion system F domain protein  34.16 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  32.46 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3330  type II secretion system protein  27.64 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0799285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8597  type II secretion system protein  31.11 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0722577  normal  0.464587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3132  type II secretion system protein  32.12 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  29.52 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  25.3 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>