22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0840 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  100 
 
 		 301 aa  579  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  49.01 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  46 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  34.23 
 
 		 288 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0673  Type II secretion system F domain protein  39.78 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  36.44 
 
 		 288 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  33.56 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  34.01 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  33.56 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  32.13 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  32.99 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  33.22 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  31.94 
 
 		 297 aa  92.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  29.93 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  30.94 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1225  Type II secretion system F domain protein  30.35 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467783 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  30.23 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  26.01 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8597  type II secretion system protein  29.28 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0722577  normal  0.464587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3132  type II secretion system protein  34.82 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3330  type II secretion system protein  28.27 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0799285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  25.58 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>