46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0782 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0782  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 297 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00284704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  27.36 
 
 		 317 aa  67  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  29.88 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  27.75 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  33.89 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  29.67 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  31.38 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  28.34 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  29.85 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  31.72 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  30 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  29.81 
 
 		 204 aa  55.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06191  hypothetical protein  28.14 
 
 		 280 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  30.32 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  29.09 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  33.97 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  30.32 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  29.21 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  27.91 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  27.37 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  26.87 
 
 		 311 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  28.31 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  27.54 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  27.7 
 
 		 292 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0610  type II secretion system protein  23.73 
 
 		 281 aa  49.7  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  27.98 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  25 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  23.93 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  31.1 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03347  hypothetical protein  23.78 
 
 		 187 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  25.13 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  27.01 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  25.16 
 
 		 426 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 297 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  28.42 
 
 		 309 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  29.7 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  28.31 
 
 		 643 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  24.84 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  31.08 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  32.95 
 
 		 323 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  30.56 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  35.77 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  31.82 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  26.03 
 
 		 287 aa  42.7  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  31.82 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>