More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3802 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3802  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
169 aa  336  9e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123417 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0153  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  74.15 
 
 
179 aa  224  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0923  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  65.75 
 
 
162 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0666  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  64.63 
 
 
149 aa  201  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6224  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  67.12 
 
 
163 aa  200  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3216  tRNA/rRNA methyltransferase  62.5 
 
 
161 aa  200  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1199  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  62.16 
 
 
150 aa  200  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.565462  normal  0.954982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7081  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  66.44 
 
 
154 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1301  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  62.84 
 
 
150 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2299  putative tRNA/rRNA methyltransferase  68.71 
 
 
158 aa  198  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.727719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0645  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  65.31 
 
 
149 aa  198  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807504  normal  0.580297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0678  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  63.27 
 
 
149 aa  197  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998737  normal  0.0166669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4629  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  68.03 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.998464  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1544  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  62.59 
 
 
153 aa  193  9e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  normal  0.0718657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2783  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  62.84 
 
 
153 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.482099  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_004310  BR1546  RNA methyltransferase  59.33 
 
 
159 aa  189  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1495  RNA methyltransferase  59.33 
 
 
159 aa  189  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3047  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  60.96 
 
 
153 aa  187  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.264748 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1620  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.79 
 
 
180 aa  187  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236894  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1383  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  59.6 
 
 
151 aa  184  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.661134  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2955  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  63.19 
 
 
154 aa  180  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649621  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2171  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.79 
 
 
153 aa  177  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2618  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  65.75 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106137  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3242  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  65.75 
 
 
156 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0365  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.33 
 
 
160 aa  168  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0832169  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1005  RNA methyltransferase  51.68 
 
 
155 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2241  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.41 
 
 
175 aa  161  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103501  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0735  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.98 
 
 
148 aa  148  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.44981 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1203  tRNA/rRNA methyltransferase  49.32 
 
 
151 aa  147  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0626663  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1346  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.68 
 
 
152 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202952  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1397  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.11 
 
 
149 aa  142  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806848  normal  0.241303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0700  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.32 
 
 
156 aa  141  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1874  RNA methyltransferase TrmH, group 2  44.52 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4386  RNA methyltransferase  41.61 
 
 
154 aa  125  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4812  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  40.94 
 
 
157 aa  121  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799981  hitchhiker  0.00015333 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1518  RNA methyltransferase  38.67 
 
 
153 aa  120  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10001  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  37.97 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.437921  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09981  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  38.61 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.582415  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  40.27 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2885  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.84 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.938343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3194  RNA methyltransferase TrmH, group 2  39.04 
 
 
153 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00355106  hitchhiker  0.0000259155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3440  RNA methyltransferase TrmH, group 2  40.41 
 
 
158 aa  117  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1147  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  40.96 
 
 
166 aa  117  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.303231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1308  rRNA methylase-like protein cspR  38 
 
 
153 aa  117  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0265  RNA methyltransferase  40.14 
 
 
154 aa  117  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0132  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.78 
 
 
154 aa  117  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4609  TrmA family RNA methyltransferase  36.99 
 
 
153 aa  117  9e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00112922  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0939  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  36.31 
 
 
160 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0264  RNA methyltransferase  40.14 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114775 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1629  tRNA/rRNA methyltransferase  35.95 
 
 
161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0540  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  38.26 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699614  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  41.89 
 
 
155 aa  115  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3896  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  38.93 
 
 
157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3974  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  38.93 
 
 
157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.818121 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4081  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  38.93 
 
 
157 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4019  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  38.93 
 
 
157 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.921331  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03464  predicted rRNA methylase  39.6 
 
 
157 aa  114  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  43.15 
 
 
157 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2407  RNA methyltransferase CspR  41.1 
 
 
154 aa  114  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03415  hypothetical protein  39.6 
 
 
157 aa  114  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0102  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  39.6 
 
 
157 aa  114  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0238  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.73 
 
 
153 aa  114  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.460006  normal  0.0379576 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3818  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  39.6 
 
 
157 aa  114  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5052  RNA methyltransferase  40.13 
 
 
157 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0599206  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14671  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  40.76 
 
 
166 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0129  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  38.93 
 
 
157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.253397  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3912  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  38.26 
 
 
157 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4979  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  39.6 
 
 
157 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4110  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  39.6 
 
 
157 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  40.14 
 
 
154 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4175  RNA methyltransferase TrmH, group 2  37.58 
 
 
156 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0099  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  38.93 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2417  hypothetical protein  38.78 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4034  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  38.93 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3498  RNA methyltransferase  40.14 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3807  RNA methyltransferase  40.14 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.509614  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3854  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.73 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3943  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  38.93 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2267  rRNA methylase  42.95 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00105703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  40.14 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2563  hypothetical protein  38.78 
 
 
149 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0616  RNA methyltransferase TrmH, group 2  41.78 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2205  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  36 
 
 
152 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0124  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.41 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3946  RNA methyltransferase  39.46 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3736  RNA methyltransferase  40.14 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0307  RNA methyltransferase  38.1 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3934  RNA methyltransferase  40.14 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000097835  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2268  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  36 
 
 
152 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00048141  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  40.14 
 
 
154 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4242  RNA methyltransferase  38.1 
 
 
154 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1327  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  40.76 
 
 
163 aa  112  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0858796 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  40.14 
 
 
154 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2721  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.65 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.647154 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0012  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.72 
 
 
153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121067  normal  0.063625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4247  RNA methyltransferase  40.14 
 
 
154 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0108586  hitchhiker  0.00213899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5103  RNA methyltransferase  39.73 
 
 
153 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4925  RNA methyltransferase  40.41 
 
 
153 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61078  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0990  RNA methyltransferase  38.26 
 
 
154 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11010  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  34 
 
 
162 aa  110  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0271045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>