More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6224 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6224  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
163 aa  324  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7081  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  90.07 
 
 
154 aa  272  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0645  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  82.55 
 
 
149 aa  253  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807504  normal  0.580297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0666  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  81.21 
 
 
149 aa  253  7e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0678  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  80.54 
 
 
149 aa  253  7e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998737  normal  0.0166669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4629  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  85.91 
 
 
176 aa  250  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.998464  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0153  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  70 
 
 
179 aa  218  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3216  tRNA/rRNA methyltransferase  67.11 
 
 
161 aa  212  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1544  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  65.99 
 
 
153 aa  209  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  normal  0.0718657 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0923  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  65.38 
 
 
162 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1199  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  63.95 
 
 
150 aa  205  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.565462  normal  0.954982 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3047  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  66.67 
 
 
153 aa  203  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.264748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2783  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  66.67 
 
 
153 aa  201  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.482099  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1301  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  63.27 
 
 
150 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1620  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  60.96 
 
 
180 aa  194  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236894  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2299  putative tRNA/rRNA methyltransferase  66 
 
 
158 aa  192  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.727719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1383  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  65.99 
 
 
151 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.661134  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1546  RNA methyltransferase  59.59 
 
 
159 aa  187  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1495  RNA methyltransferase  59.59 
 
 
159 aa  187  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2171  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.5 
 
 
153 aa  185  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2955  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  61.59 
 
 
154 aa  183  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649621  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2241  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  60.13 
 
 
175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103501  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0365  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.66 
 
 
160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0832169  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3802  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  67.12 
 
 
169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123417 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2618  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  69.39 
 
 
156 aa  167  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106137  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3242  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  67.57 
 
 
156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1397  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.63 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806848  normal  0.241303 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1203  tRNA/rRNA methyltransferase  53.64 
 
 
151 aa  161  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0626663  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1005  RNA methyltransferase  51.35 
 
 
155 aa  158  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1346  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.64 
 
 
152 aa  157  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202952  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0735  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.35 
 
 
148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.44981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0700  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.33 
 
 
156 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4038  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.37 
 
 
154 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0132  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.05 
 
 
154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  45.1 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2460  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.03 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000877061 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0124  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.38 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0238  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.67 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.460006  normal  0.0379576 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3854  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.05 
 
 
157 aa  125  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4925  RNA methyltransferase  42.95 
 
 
153 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61078  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5052  RNA methyltransferase  42.95 
 
 
157 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0599206  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5103  RNA methyltransferase  42.95 
 
 
153 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  42.31 
 
 
154 aa  121  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0413  RNA methyltransferase  42.95 
 
 
153 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.85413 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1308  rRNA methylase-like protein cspR  39.47 
 
 
153 aa  120  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3440  RNA methyltransferase TrmH, group 2  44.74 
 
 
158 aa  120  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2267  rRNA methylase  42.48 
 
 
158 aa  120  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00105703  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2539  RNA methyltransferase  42.41 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.438382  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  41.67 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3736  RNA methyltransferase  42.38 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4242  RNA methyltransferase  41.72 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3934  RNA methyltransferase  42.38 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000097835  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3946  RNA methyltransferase  43.05 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0265  RNA methyltransferase  41.67 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4247  RNA methyltransferase  42.31 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0108586  hitchhiker  0.00213899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1874  RNA methyltransferase TrmH, group 2  42.57 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1518  RNA methyltransferase  39.47 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3807  RNA methyltransferase  42.76 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.509614  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0307  RNA methyltransferase  42.76 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3498  RNA methyltransferase  42.68 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  42.95 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2563  hypothetical protein  39.6 
 
 
149 aa  118  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  42.28 
 
 
154 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3194  RNA methyltransferase TrmH, group 2  39.33 
 
 
153 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00355106  hitchhiker  0.0000259155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2736  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.05 
 
 
155 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.372982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0127  RNA methyltransferase  38.89 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00636988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0264  RNA methyltransferase  40.13 
 
 
154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0616  RNA methyltransferase TrmH, group 2  42.95 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  42.28 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11010  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  37.34 
 
 
162 aa  117  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0271045  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0540  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  41.4 
 
 
156 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699614  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0432  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  43.79 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2417  hypothetical protein  39.46 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03464  predicted rRNA methylase  42.04 
 
 
157 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0102  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  42.04 
 
 
157 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3818  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  42.04 
 
 
157 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03415  hypothetical protein  42.04 
 
 
157 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4609  TrmA family RNA methyltransferase  36.67 
 
 
153 aa  114  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00112922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4110  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  42.04 
 
 
157 aa  114  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4979  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  42.04 
 
 
157 aa  114  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0099  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  41.4 
 
 
157 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3943  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  41.4 
 
 
157 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4034  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  41.4 
 
 
157 aa  114  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4175  RNA methyltransferase TrmH, group 2  40.76 
 
 
156 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00152  RNA methyltransferase  39.62 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3974  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  39.74 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.818121 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3896  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  39.74 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4386  RNA methyltransferase  42.04 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2407  RNA methyltransferase CspR  40.4 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3912  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  39.1 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002216  tRNA (cytosine34-2'-O-)-methyltransferase  38.99 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0272  RNA methyltransferase  38.85 
 
 
156 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2268  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  36.84 
 
 
152 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00048141  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3484  RNA methyltransferase TrmH, group 2  42.95 
 
 
153 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2205  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  36.84 
 
 
152 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4019  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  39.74 
 
 
157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.921331  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4081  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  39.74 
 
 
157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.25 
 
 
152 aa  111  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.854981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4396  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  39.07 
 
 
153 aa  111  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5861  putative rRNA methylase  40.79 
 
 
153 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>