More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0645 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0645  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807504  normal  0.580297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0678  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  89.93 
 
 		 149 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998737  normal  0.0166669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0666  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  90.6 
 
 		 149 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6224  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  82.55 
 
 		 163 aa  253  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7081  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  82.55 
 
 		 154 aa  246  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4629  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  85.23 
 
 		 176 aa  241  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.998464  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0153  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  69.59 
 
 		 179 aa  213  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1544  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  61.22 
 
 		 153 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  normal  0.0718657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1199  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  59.18 
 
 		 150 aa  196  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.565462  normal  0.954982 
 
 
-
 
NC_004310  BR1546  RNA methyltransferase  60.54 
 
 		 159 aa  194  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2783  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  63.95 
 
 		 153 aa  194  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.482099  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1620  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  59.59 
 
 		 180 aa  194  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236894  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1495  RNA methyltransferase  60.54 
 
 		 159 aa  194  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3216  tRNA/rRNA methyltransferase  61.22 
 
 		 161 aa  194  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0923  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  61.49 
 
 		 162 aa  193  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3047  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  63.27 
 
 		 153 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.264748 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1301  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  59.18 
 
 		 150 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2171  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  57.14 
 
 		 153 aa  188  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2299  putative tRNA/rRNA methyltransferase  61.49 
 
 		 158 aa  183  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.727719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1383  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  60.54 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.661134  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3802  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  65.31 
 
 		 169 aa  174  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3242  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  65.54 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0365  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.76 
 
 		 160 aa  167  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0832169  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2955  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.76 
 
 		 154 aa  163  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649621  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2618  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  64.63 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106137  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2241  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.08 
 
 		 175 aa  162  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1005  RNA methyltransferase  52.03 
 
 		 155 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1346  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.06 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202952  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1397  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.05 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806848  normal  0.241303 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0735  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.68 
 
 		 148 aa  150  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.44981 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1203  tRNA/rRNA methyltransferase  49.32 
 
 		 151 aa  144  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0626663  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0700  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.94 
 
 		 156 aa  143  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  44.37 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4038  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.71 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3854  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.05 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1874  RNA methyltransferase TrmH, group 2  45.64 
 
 		 156 aa  125  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0132  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.72 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0124  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.72 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  43.92 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0307  RNA methyltransferase  42.38 
 
 		 154 aa  123  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0272  RNA methyltransferase  39.74 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0540  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  40.4 
 
 		 156 aa  120  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4609  TrmA family RNA methyltransferase  40 
 
 		 153 aa  120  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00112922  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  40.4 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4247  RNA methyltransferase  41.72 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0108586  hitchhiker  0.00213899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0238  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.460006  normal  0.0379576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3736  RNA methyltransferase  41.83 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3934  RNA methyltransferase  41.83 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000097835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3498  RNA methyltransferase  41.06 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5052  RNA methyltransferase  41.06 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0599206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2539  RNA methyltransferase  40.4 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.438382  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4925  RNA methyltransferase  41.06 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4242  RNA methyltransferase  41.06 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2407  RNA methyltransferase CspR  42.38 
 
 		 154 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3194  RNA methyltransferase TrmH, group 2  39.33 
 
 		 153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00355106  hitchhiker  0.0000259155 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1518  RNA methyltransferase  39.86 
 
 		 153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  41.33 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0264  RNA methyltransferase  40.79 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3807  RNA methyltransferase  41.18 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.509614  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  41.33 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0874  RNA methyltransferase  41.72 
 
 		 159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.812063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0052  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  40.79 
 
 		 154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5861  putative rRNA methylase  40.79 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0099  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  39.07 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4034  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  39.07 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3943  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  39.07 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  40.67 
 
 		 154 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2460  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.38 
 
 		 155 aa  116  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000877061 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03464  predicted rRNA methylase  39.07 
 
 		 157 aa  116  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0265  RNA methyltransferase  39.74 
 
 		 154 aa  116  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0102  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  39.07 
 
 		 157 aa  116  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03415  hypothetical protein  39.07 
 
 		 157 aa  116  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3818  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  39.07 
 
 		 157 aa  116  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3946  RNA methyltransferase  40 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5103  RNA methyltransferase  39.74 
 
 		 153 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3440  RNA methyltransferase TrmH, group 2  40.4 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2563  hypothetical protein  37.58 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0310  RNA methyltransferase TrmH, group 2  37.75 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4396  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  40.4 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2768  RNA methyltransferase  39.74 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1677  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.93 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.451539  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4175  RNA methyltransferase TrmH, group 2  38.41 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04710  RNA methyltransferase TrmH, group 2  39.33 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0413  RNA methyltransferase  39.74 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.85413 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1308  rRNA methylase-like protein cspR  39.19 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4979  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  39.07 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2906  RNA methyltransferase  39.74 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67710  putative rRNA methylase  40.13 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281538  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2267  rRNA methylase  39.87 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00105703  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4110  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  39.07 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4019  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  37.75 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.921331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0452  RNA methyltransferase  38.41 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3912  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  37.75 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4081  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  37.75 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1418  RNA methyltransferase  39.07 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3201  RNA methyltransferase  39.07 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0668  RNA methyltransferase  39.07 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2845  RNA methyltransferase  39.07 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3974  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  37.75 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.818121 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0174  RNA methyltransferase  39.07 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>