More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1005 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1005  RNA methyltransferase  100 
 
 
155 aa  325  2.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1620  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  66.89 
 
 
180 aa  208  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236894  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1546  RNA methyltransferase  65.77 
 
 
159 aa  202  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1495  RNA methyltransferase  65.77 
 
 
159 aa  202  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3216  tRNA/rRNA methyltransferase  63.95 
 
 
161 aa  198  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3047  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  57.62 
 
 
153 aa  185  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.264748 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1544  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  59.59 
 
 
153 aa  184  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  normal  0.0718657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2783  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.67 
 
 
153 aa  183  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.482099  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2171  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  57.05 
 
 
153 aa  180  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1301  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.03 
 
 
150 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0153  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.02 
 
 
179 aa  169  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0365  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.48 
 
 
160 aa  168  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0832169  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1199  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.16 
 
 
150 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.565462  normal  0.954982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0923  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  57.43 
 
 
162 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2299  putative tRNA/rRNA methyltransferase  55.03 
 
 
158 aa  165  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.727719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2955  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.67 
 
 
154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649621  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0645  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.03 
 
 
149 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807504  normal  0.580297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1383  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56 
 
 
151 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.661134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6224  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.35 
 
 
163 aa  158  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7081  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.35 
 
 
154 aa  157  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0678  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.32 
 
 
149 aa  157  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998737  normal  0.0166669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0666  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.32 
 
 
149 aa  156  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2241  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 
175 aa  155  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103501  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4629  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.97 
 
 
176 aa  153  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.998464  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1346  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.37 
 
 
152 aa  153  9e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202952  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1203  tRNA/rRNA methyltransferase  48.65 
 
 
151 aa  152  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0626663  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3802  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.68 
 
 
169 aa  148  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1397  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 
149 aa  147  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806848  normal  0.241303 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0265  RNA methyltransferase  47.71 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0700  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.63 
 
 
156 aa  144  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0307  RNA methyltransferase  47.1 
 
 
154 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0124  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.41 
 
 
154 aa  142  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0132  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.41 
 
 
154 aa  142  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0264  RNA methyltransferase  45.75 
 
 
154 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114775 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0075  RNA methyltransferase  45.22 
 
 
162 aa  141  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0081  RNA methyltransferase  45.22 
 
 
162 aa  141  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4135  RNA methyltransferase  45.22 
 
 
162 aa  141  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438164  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4038  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.41 
 
 
154 aa  141  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4812  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  45.1 
 
 
157 aa  140  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799981  hitchhiker  0.00015333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67710  putative rRNA methylase  46.05 
 
 
153 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281538  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3854  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.81 
 
 
157 aa  140  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3440  RNA methyltransferase TrmH, group 2  47.06 
 
 
158 aa  140  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5861  putative rRNA methylase  45.39 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00152  RNA methyltransferase  46.1 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3498  RNA methyltransferase  44.44 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4396  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  43.71 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4242  RNA methyltransferase  45.81 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2563  hypothetical protein  44.67 
 
 
149 aa  137  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4247  RNA methyltransferase  43.79 
 
 
154 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0108586  hitchhiker  0.00213899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4019  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  44.44 
 
 
157 aa  136  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.921331  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4081  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  44.44 
 
 
157 aa  136  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3946  RNA methyltransferase  43.51 
 
 
153 aa  136  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002216  tRNA (cytosine34-2'-O-)-methyltransferase  44.81 
 
 
159 aa  135  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3912  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  44.44 
 
 
157 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  43.79 
 
 
154 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  43.79 
 
 
154 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3896  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  43.79 
 
 
157 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3974  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  43.79 
 
 
157 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.818121 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2618  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.16 
 
 
156 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106137  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3736  RNA methyltransferase  43.14 
 
 
154 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3807  RNA methyltransferase  43.14 
 
 
154 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.509614  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0735  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.57 
 
 
148 aa  135  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.44981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3934  RNA methyltransferase  43.14 
 
 
154 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000097835  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  43.14 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2407  RNA methyltransferase CspR  44.37 
 
 
154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3242  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.41 
 
 
156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0359  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.7 
 
 
174 aa  134  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012351  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0383  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.08 
 
 
168 aa  134  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0099  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  43.14 
 
 
157 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  42.48 
 
 
154 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3943  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  43.14 
 
 
157 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4034  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  43.14 
 
 
157 aa  133  8e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2417  hypothetical protein  43.33 
 
 
149 aa  133  9e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03464  predicted rRNA methylase  43.14 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4386  RNA methyltransferase  42.11 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3818  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  43.14 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03415  hypothetical protein  43.14 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4110  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  43.14 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2267  rRNA methylase  43.79 
 
 
158 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00105703  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4979  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  43.14 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0552  RNA methyltransferase  42.76 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242542  normal  0.84663 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0102  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  43.14 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5103  RNA methyltransferase  44.44 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1677  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.38 
 
 
161 aa  131  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.451539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1670  RNA methyltransferase  43.92 
 
 
165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03960  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase YibK  43.51 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  44.52 
 
 
155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04710  RNA methyltransferase TrmH, group 2  42.11 
 
 
153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0129  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  41.83 
 
 
157 aa  130  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.253397  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  41.18 
 
 
154 aa  130  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3301  RNA methyltransferase  41.83 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0858286 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1943  RNA methyltransferase  41.18 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2133  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  43.23 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3484  RNA methyltransferase TrmH, group 2  47.06 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16300  predicted rRNA methylase SpoU family  43.14 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.292915  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2799  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase  45.51 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0990  RNA methyltransferase  42.48 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411714  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2343  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  40.52 
 
 
159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.2665  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3577  RNA methyltransferase  45.75 
 
 
154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2539  RNA methyltransferase  39.22 
 
 
159 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.438382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>