More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1037 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1037  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
497 aa  938    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0301781 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1582  NADH dehydrogenase (quinone)  52.65 
 
 
501 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  47.69 
 
 
493 aa  368  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2663  NADH dehydrogenase (quinone)  49.43 
 
 
479 aa  336  5e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  47.14 
 
 
501 aa  324  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2741  NADH dehydrogenase (quinone)  46.46 
 
 
482 aa  300  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405496  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1001  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  46.17 
 
 
494 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.629716 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0813  NADH dehydrogenase (quinone)  46.73 
 
 
487 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.461981  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0743  NADH dehydrogenase (quinone)  48.01 
 
 
475 aa  245  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01560  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  37.14 
 
 
493 aa  223  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.42 
 
 
492 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.87 
 
 
492 aa  212  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  32.29 
 
 
499 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  34.02 
 
 
486 aa  208  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.64 
 
 
492 aa  205  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1635  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.72 
 
 
502 aa  195  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193581  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  35.9 
 
 
501 aa  194  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.65 
 
 
507 aa  188  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_002978  WD1107  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.32 
 
 
488 aa  187  4e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.980044  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.83 
 
 
501 aa  180  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5153  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.14 
 
 
548 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.939463  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2286  NADH dehydrogenase (quinone)  35.34 
 
 
437 aa  177  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3447  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.28 
 
 
541 aa  170  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209361  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2863  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.18 
 
 
498 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.845476  normal  0.745609 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  28.25 
 
 
500 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0179  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.16 
 
 
491 aa  163  6e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.490475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12060  NADH dehydrogenase I subunit L  26.73 
 
 
506 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000252399  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  28.66 
 
 
500 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  34.52 
 
 
1245 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0121  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  26.82 
 
 
491 aa  160  3e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.91 
 
 
472 aa  160  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  29.58 
 
 
498 aa  157  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  29.74 
 
 
498 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  30.68 
 
 
504 aa  156  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 
501 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2712  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.75 
 
 
574 aa  154  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0844  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.86 
 
 
548 aa  154  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.639175  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  29.48 
 
 
500 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  33.63 
 
 
1265 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.03 
 
 
523 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000590255  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.43 
 
 
513 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0731  quinone dependent NADH dehydrogenase  31.65 
 
 
511 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156813  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  34.81 
 
 
1265 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  29.12 
 
 
504 aa  151  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.07 
 
 
500 aa  151  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  26.55 
 
 
498 aa  150  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 
500 aa  150  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3667  NADH dehydrogenase (quinone)  34.97 
 
 
496 aa  150  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.09 
 
 
538 aa  149  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  28.67 
 
 
505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  30.95 
 
 
502 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1741  NADH dehydrogenase subunit M  29.53 
 
 
604 aa  146  7.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.56797  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.48 
 
 
545 aa  146  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3455  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.74 
 
 
488 aa  146  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112327  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  33.51 
 
 
1264 aa  146  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.68 
 
 
496 aa  146  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2341  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.47 
 
 
504 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0097  NADH dehydrogenase (quinone)  28.97 
 
 
505 aa  145  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.988192  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1431  NADH dehydrogenase (quinone)  32.3 
 
 
498 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352854  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3954  NADH dehydrogenase (quinone)  34.06 
 
 
497 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3534  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.81 
 
 
532 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  32.61 
 
 
480 aa  143  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3285  NADH dehydrogenase (quinone)  33.24 
 
 
496 aa  143  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0676667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.96 
 
 
488 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1139  hydrogenase 4 subunit F  29.16 
 
 
488 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0485021  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  32.12 
 
 
662 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.51 
 
 
538 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.02 
 
 
566 aa  141  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479761  normal  0.594337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0210  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.33 
 
 
525 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.924509  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6653  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  30.96 
 
 
529 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1217  NADH dehydrogenase subunit M  30.65 
 
 
614 aa  140  6e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0574  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.73 
 
 
535 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0486  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.57 
 
 
535 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.34 
 
 
501 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1606  NADH dehydrogenase subunit M  30.95 
 
 
626 aa  139  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0584  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.73 
 
 
535 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  31.87 
 
 
480 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1110  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.47 
 
 
512 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0596  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.73 
 
 
535 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.395006 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0890  NADH dehydrogenase subunit M  28.54 
 
 
613 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.514114  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1398  NADH dehydrogenase (quinone)  34.16 
 
 
498 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3628  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.93 
 
 
487 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0563  NADH dehydrogenase (quinone)  30.09 
 
 
539 aa  137  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.850315  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35440  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  29.47 
 
 
540 aa  137  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2742  NADH dehydrogenase (quinone)  35.17 
 
 
497 aa  137  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2966  NADH dehydrogenase (quinone)  34 
 
 
501 aa  137  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.278298 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  30.75 
 
 
577 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3401  F420H2 dehydrogenase subunit N  30.99 
 
 
481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280357  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0044  NADH dehydrogenase (quinone)  30.18 
 
 
525 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.33239 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0812  NADH dehydrogenase (quinone)  35.73 
 
 
503 aa  134  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.114491  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  31.9 
 
 
669 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1369  NADH dehydrogenase I chain N  26.1 
 
 
457 aa  134  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0931303  normal  0.767533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4628  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.81 
 
 
511 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14770  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.04 
 
 
510 aa  134  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18278  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1601  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.95 
 
 
499 aa  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.92 
 
 
522 aa  133  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2871  NADH dehydrogenase (quinone)  28.32 
 
 
490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  34.01 
 
 
499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0867  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.75 
 
 
493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.704502 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04211  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.8 
 
 
516 aa  131  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>