More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04211 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04211  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  100 
 
 
516 aa  1009    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3731  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  72.09 
 
 
511 aa  681    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.78206  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1540  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.52 
 
 
540 aa  381  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.010926 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3807  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45 
 
 
506 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.5869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  43.5 
 
 
505 aa  357  3.9999999999999996e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19533  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2851  NADH dehydrogenase (quinone)  42.44 
 
 
505 aa  356  5.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3717  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46 
 
 
539 aa  355  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0674  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.66 
 
 
511 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.15 
 
 
510 aa  347  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0135154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.12 
 
 
511 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1357  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.03 
 
 
503 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.726443  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1128  NADH dehydrogenase (quinone)  41.97 
 
 
540 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.556203  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.25 
 
 
503 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104393  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0699  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  42.45 
 
 
530 aa  336  5e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50710  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  50.78 
 
 
499 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1102  NADH dehydrogenase (quinone)  45.16 
 
 
507 aa  333  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.164573  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.49 
 
 
503 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0994  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.71 
 
 
503 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.949709  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19550  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  47.14 
 
 
499 aa  332  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216033  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0061  NADH dehydrogenase (quinone)  43.44 
 
 
508 aa  331  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0495  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.41 
 
 
504 aa  329  7e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4322  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  47.8 
 
 
499 aa  329  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891162  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0150  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.88 
 
 
511 aa  326  6e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3984  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  42.38 
 
 
503 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0901  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.36 
 
 
503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1680  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.49 
 
 
511 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.962527  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0502  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.45 
 
 
542 aa  311  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.321339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1851  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.1 
 
 
559 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.059579 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0437  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.26 
 
 
542 aa  310  5e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0958706  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2228  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.74 
 
 
559 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3533  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.82 
 
 
543 aa  306  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.69 
 
 
501 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0476084  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2476  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.53 
 
 
578 aa  296  6e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1384  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.36 
 
 
578 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0617713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4731  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.79 
 
 
598 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.840154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.9 
 
 
541 aa  295  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.85253  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3512  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.56 
 
 
559 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.523861  hitchhiker  0.00169463 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3447  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.51 
 
 
540 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.02 
 
 
559 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.260298  normal  0.224731 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3254  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.28 
 
 
561 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0445777  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3473  monovalent cation/proton antiporter, MnhD/PhaD subunit  36.92 
 
 
558 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3713  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.33 
 
 
540 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1603  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.09 
 
 
568 aa  286  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.92 
 
 
544 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5079  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.75 
 
 
551 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.793582 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1589  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.85 
 
 
554 aa  282  9e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3312  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.22 
 
 
559 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3291  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.16 
 
 
601 aa  281  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.433006  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4614  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.75 
 
 
561 aa  280  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.354108  hitchhiker  0.00768927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2656  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.48 
 
 
535 aa  280  5e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3623  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.82 
 
 
539 aa  280  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0168629  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5266  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.08 
 
 
543 aa  279  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.6 
 
 
539 aa  277  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1008  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.59 
 
 
535 aa  276  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.757465  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0032  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.39 
 
 
540 aa  276  6e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1287  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.69 
 
 
576 aa  273  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.592615  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2486  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  43.74 
 
 
502 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1522  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.36 
 
 
573 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0664995  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3907  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.41 
 
 
572 aa  270  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5154  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.53 
 
 
534 aa  250  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35440  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  34.95 
 
 
540 aa  243  7.999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  35.15 
 
 
501 aa  241  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  34.93 
 
 
504 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
505 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  35.43 
 
 
500 aa  240  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  32.94 
 
 
500 aa  238  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  32.43 
 
 
500 aa  236  8e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.63 
 
 
501 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  34.99 
 
 
498 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3871  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.15 
 
 
539 aa  225  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0097  NADH dehydrogenase (quinone)  32.56 
 
 
505 aa  224  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.988192  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  33.01 
 
 
504 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2871  NADH dehydrogenase (quinone)  38.3 
 
 
490 aa  224  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.21 
 
 
545 aa  224  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  33.72 
 
 
502 aa  223  8e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1160  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.46 
 
 
495 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0044  NADH dehydrogenase (quinone)  33.08 
 
 
525 aa  221  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.33239 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  30.72 
 
 
498 aa  219  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.33 
 
 
500 aa  219  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0535  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.86 
 
 
498 aa  219  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.64 
 
 
538 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.71 
 
 
543 aa  218  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  33.33 
 
 
498 aa  216  9e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0496  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.34 
 
 
565 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0968  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.58 
 
 
498 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0949  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.58 
 
 
498 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0210  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.81 
 
 
525 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.924509  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.78 
 
 
538 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2341  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34 
 
 
504 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2437  NADH dehydrogenase (quinone)  33.65 
 
 
530 aa  211  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.366515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.43 
 
 
562 aa  209  8e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.77 
 
 
523 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000590255  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0731  quinone dependent NADH dehydrogenase  33.86 
 
 
511 aa  206  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156813  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4892  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.01 
 
 
552 aa  206  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3816  NADH dehydrogenase (quinone)  35.11 
 
 
509 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.818014  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0669  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.16 
 
 
538 aa  203  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3185  NADH dehydrogenase (quinone)  34.9 
 
 
552 aa  203  8e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25180  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  31.85 
 
 
526 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0648794  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1110  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  40 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.83 
 
 
513 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>