69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2669 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  100 
 
 
277 aa  542  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  35.07 
 
 
273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  36.23 
 
 
274 aa  158  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  34.83 
 
 
276 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  34.26 
 
 
282 aa  156  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  34.46 
 
 
291 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  34.07 
 
 
304 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  33.33 
 
 
274 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  36.9 
 
 
258 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  35.07 
 
 
276 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  37.85 
 
 
288 aa  149  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  36.84 
 
 
261 aa  148  9e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  33.83 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  33.69 
 
 
278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  36.54 
 
 
261 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  35.21 
 
 
281 aa  142  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  33.45 
 
 
282 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  31.88 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  39.93 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  36.32 
 
 
328 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  34.04 
 
 
290 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  35.23 
 
 
262 aa  139  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  35.93 
 
 
300 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  37.55 
 
 
269 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  30.53 
 
 
1012 aa  134  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  34.17 
 
 
284 aa  132  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  32.97 
 
 
274 aa  132  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  36.88 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  34.22 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  34.63 
 
 
1701 aa  129  6e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  33.22 
 
 
292 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  32.58 
 
 
289 aa  126  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  33.85 
 
 
295 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  35.14 
 
 
272 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  32.38 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  31.91 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  33.71 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  31.54 
 
 
271 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  33.33 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  34.33 
 
 
938 aa  95.9  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  32.23 
 
 
1546 aa  94.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  39.41 
 
 
282 aa  89.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  24.07 
 
 
1742 aa  75.5  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  25.74 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  33.77 
 
 
469 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  26.87 
 
 
718 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  31.17 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  26.09 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  27.4 
 
 
2028 aa  57.4  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  31.2 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.7 
 
 
409 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15329  predicted protein  19.86 
 
 
533 aa  48.9  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  35.45 
 
 
271 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  30.52 
 
 
275 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  29.89 
 
 
272 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  27.74 
 
 
276 aa  46.2  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51869  calcium channel protein  23.1 
 
 
2206 aa  46.6  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.56529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  28.09 
 
 
276 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  27.56 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  29.37 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  29.93 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  29.37 
 
 
279 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  30.71 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  29.87 
 
 
289 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  29.87 
 
 
284 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  29.87 
 
 
284 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  29.87 
 
 
284 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  29.87 
 
 
284 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  24.59 
 
 
292 aa  42  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>