55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0322 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  100 
 
 		 288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  60.84 
 
 		 300 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  54.33 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  49.42 
 
 		 262 aa  257  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  54.51 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  48.78 
 
 		 261 aa  246  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  52.71 
 
 		 290 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  49.2 
 
 		 261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  48.61 
 
 		 274 aa  244  8e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  51.87 
 
 		 280 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  48.44 
 
 		 278 aa  242  6e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  48.94 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  50.57 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  51.25 
 
 		 277 aa  232  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  47.64 
 
 		 281 aa  232  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  46.62 
 
 		 271 aa  229  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  48.63 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  48.72 
 
 		 272 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  47.39 
 
 		 289 aa  209  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  42.05 
 
 		 290 aa  188  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  39.46 
 
 		 278 aa  188  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  42.34 
 
 		 328 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  37.98 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  43.85 
 
 		 312 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  36.09 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  44.59 
 
 		 269 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  36.43 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  34.19 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  44.93 
 
 		 282 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  37.95 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  37.95 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  36.73 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  35.68 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  32.21 
 
 		 282 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  34.18 
 
 		 415 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  35.48 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  33.59 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  31.3 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  30.99 
 
 		 718 aa  122  8e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  35.46 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  35.47 
 
 		 469 aa  109  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  29.82 
 
 		 1701 aa  108  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  29.79 
 
 		 938 aa  89.4  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  29.71 
 
 		 1012 aa  82.4  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  36.05 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  26.02 
 
 		 1546 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  22.66 
 
 		 1742 aa  57.4  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51869  calcium channel protein  22.69 
 
 		 2206 aa  57.4  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.56529 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  23.67 
 
 		 2110 aa  55.8  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  20.57 
 
 		 2028 aa  52.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15329  predicted protein  25.79 
 
 		 533 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  23.03 
 
 		 289 aa  45.8  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  23.28 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  24.2 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  22.74 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>