58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1904 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  100 
 
 		 274 aa  550  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  63.85 
 
 		 282 aa  322  4e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  59.86 
 
 		 284 aa  311  6.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  54.34 
 
 		 276 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  54.37 
 
 		 273 aa  301  6.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  52.69 
 
 		 276 aa  295  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  54.9 
 
 		 274 aa  291  7e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  53.23 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  52.01 
 
 		 282 aa  288  8e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  50.9 
 
 		 291 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  37.4 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  33.58 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  35.27 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  33.82 
 
 		 274 aa  153  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  35.29 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  33.82 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  33.93 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  31.92 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  34.75 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  35.48 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  31.98 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  31.8 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  36.11 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  28.74 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  32.24 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  30.58 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  32.41 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  30.65 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  28.73 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  31.88 
 
 		 277 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  28.04 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  29.1 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  29.7 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  27.68 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  28.08 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  27.27 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  29.86 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  28.47 
 
 		 1701 aa  99.4  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  28.97 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  25.66 
 
 		 938 aa  88.2  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  26.18 
 
 		 718 aa  87.8  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  28.78 
 
 		 469 aa  86.7  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  23.43 
 
 		 1546 aa  75.9  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  27.56 
 
 		 1742 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  20.71 
 
 		 1012 aa  63.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  35.48 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  25.95 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  26.07 
 
 		 2028 aa  50.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  25.36 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  31.65 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  24.86 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  28.39 
 
 		 275 aa  46.2  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  28.36 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  24.29 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  20.23 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  28.79 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  26.06 
 
 		 279 aa  42.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>