74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2590 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  100 
 
 
282 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  52.4 
 
 
290 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  46.95 
 
 
281 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  51.75 
 
 
278 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  54.71 
 
 
328 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  47.97 
 
 
269 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  47.25 
 
 
272 aa  205  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  44.29 
 
 
292 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  50.43 
 
 
277 aa  202  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  40.37 
 
 
278 aa  201  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  46.15 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  42.55 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  43.77 
 
 
268 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  48.26 
 
 
295 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  39.11 
 
 
315 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  45.25 
 
 
258 aa  191  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  40.59 
 
 
289 aa  191  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  43.88 
 
 
290 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  44.39 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  44.74 
 
 
288 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  42.24 
 
 
271 aa  189  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  37.41 
 
 
261 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  47.53 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  47.09 
 
 
280 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  44.14 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  43.67 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  30.74 
 
 
284 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  33.81 
 
 
415 aa  143  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  30.04 
 
 
276 aa  142  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  29.96 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  28.41 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  32.16 
 
 
276 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  32.1 
 
 
273 aa  128  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  29.2 
 
 
274 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  28.95 
 
 
291 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  33.33 
 
 
718 aa  123  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  28.95 
 
 
282 aa  122  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  29.07 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  26.34 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  35.45 
 
 
469 aa  112  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  27.34 
 
 
938 aa  89.7  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  27.56 
 
 
1701 aa  89  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  34.63 
 
 
277 aa  85.5  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0277523 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  24.39 
 
 
2110 aa  80.5  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  22.96 
 
 
1742 aa  66.6  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  23.33 
 
 
1546 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  25.12 
 
 
2028 aa  57.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  19.54 
 
 
1012 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51869  calcium channel protein  21.08 
 
 
2206 aa  53.5  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.56529 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  29.29 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  24.62 
 
 
295 aa  53.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  27.01 
 
 
302 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  25.37 
 
 
275 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  24.75 
 
 
289 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  24.75 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  24.88 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  24.88 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  28.41 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  24.88 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  24.88 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  22.63 
 
 
311 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  25 
 
 
289 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  22.73 
 
 
279 aa  46.2  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  22.4 
 
 
308 aa  45.8  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  24.4 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  25 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  26.86 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  27.08 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  23.4 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  23.5 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  24.38 
 
 
272 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  24.83 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  25.25 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.13 
 
 
409 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>