53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1761 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  100 
 
 		 289 aa  584  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  57.99 
 
 		 295 aa  298  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  60.85 
 
 		 277 aa  271  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  52.77 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  51.35 
 
 		 268 aa  267  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  54.62 
 
 		 272 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  48.55 
 
 		 280 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  49.28 
 
 		 280 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  47.47 
 
 		 262 aa  256  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  49.8 
 
 		 274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  48.74 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  47.2 
 
 		 261 aa  249  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  49.64 
 
 		 292 aa  249  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  48.23 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  44.73 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  47.39 
 
 		 288 aa  238  8e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  45.15 
 
 		 271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  43.68 
 
 		 290 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  48.23 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  42.91 
 
 		 278 aa  223  4e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  40.58 
 
 		 278 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  43.73 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  43.68 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  36.59 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  46.22 
 
 		 282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  36.23 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  31.45 
 
 		 276 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  33.21 
 
 		 415 aa  142  9e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  29.71 
 
 		 274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  29.3 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  29.85 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  28.57 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  32.58 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  29.86 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  28.32 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  33.2 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  26.69 
 
 		 276 aa  126  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  29.46 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  31.25 
 
 		 718 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  27.55 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  31.65 
 
 		 469 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  27 
 
 		 1701 aa  92.4  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  25.27 
 
 		 1742 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  26.15 
 
 		 938 aa  66.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  26.06 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  22.49 
 
 		 1546 aa  57.4  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  26.19 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  23.63 
 
 		 1012 aa  53.1  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  24.75 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  27.86 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  25.12 
 
 		 2028 aa  42.7  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  25.95 
 
 		 273 aa  42.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15329  predicted protein  23.13 
 
 		 533 aa  42.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>