54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0966 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  100 
 
 		 281 aa  560  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  62.21 
 
 		 290 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  65.61 
 
 		 328 aa  286  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  50.37 
 
 		 278 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  56.15 
 
 		 268 aa  248  8e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  51.27 
 
 		 274 aa  238  9e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  47.15 
 
 		 261 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  47.64 
 
 		 288 aa  232  6e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  50 
 
 		 258 aa  228  8e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  54.44 
 
 		 269 aa  225  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  46.48 
 
 		 278 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  49.77 
 
 		 262 aa  223  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  51.13 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  47.64 
 
 		 261 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  51 
 
 		 272 aa  217  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  48.7 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  51.06 
 
 		 277 aa  215  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  43.59 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  46.33 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  44.73 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  47.91 
 
 		 280 aa  208  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  46.57 
 
 		 300 aa  208  7e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  47.86 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  46.24 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  37.55 
 
 		 315 aa  192  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  42.51 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  31.62 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  35.79 
 
 		 274 aa  153  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  35.23 
 
 		 415 aa  152  8e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  32.18 
 
 		 276 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  32.92 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  32.09 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  33.58 
 
 		 282 aa  135  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  35.95 
 
 		 718 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  32.58 
 
 		 274 aa  132  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  39.01 
 
 		 469 aa  128  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  28.74 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  31.73 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  29.6 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  31.35 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  35.21 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  27.64 
 
 		 1701 aa  90.5  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  30.26 
 
 		 938 aa  80.1  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  23.72 
 
 		 1742 aa  71.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  26.02 
 
 		 2028 aa  68.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  27.38 
 
 		 1546 aa  63.5  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  23.43 
 
 		 1012 aa  60.1  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  23.26 
 
 		 2110 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  27.68 
 
 		 311 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15329  predicted protein  18.98 
 
 		 533 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51869  calcium channel protein  17.65 
 
 		 2206 aa  46.2  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.56529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.92 
 
 		 409 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  28.57 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  23.91 
 
 		 419 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>