47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_43878 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  100 
 
 		 469 aa  964    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  49.82 
 
 		 718 aa  275  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  39.73 
 
 		 415 aa  273  7e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  36.64 
 
 		 281 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  36.97 
 
 		 278 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  35.95 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  35.74 
 
 		 271 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  34.53 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  36.22 
 
 		 290 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  31.87 
 
 		 258 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  30.92 
 
 		 288 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  33.47 
 
 		 274 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  34.63 
 
 		 268 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  30.53 
 
 		 261 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  30.16 
 
 		 262 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  36.09 
 
 		 292 aa  111  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  32.83 
 
 		 277 aa  108  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  31.41 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  30.51 
 
 		 272 aa  106  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  29.67 
 
 		 261 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  29.13 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  28.52 
 
 		 273 aa  100  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  32.17 
 
 		 295 aa  97.8  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  30.42 
 
 		 276 aa  97.8  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  27.03 
 
 		 290 aa  96.7  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  31.6 
 
 		 280 aa  96.7  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  30.6 
 
 		 280 aa  95.9  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  32.37 
 
 		 312 aa  95.5  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  34.39 
 
 		 282 aa  94  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  27.69 
 
 		 274 aa  92.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  31.72 
 
 		 289 aa  92.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  29.89 
 
 		 276 aa  90.9  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  28.23 
 
 		 274 aa  90.9  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  28.06 
 
 		 1701 aa  89  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  26.97 
 
 		 274 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  26.38 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  26.38 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  26.19 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  28.14 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  30.16 
 
 		 269 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  25.67 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  27.21 
 
 		 938 aa  63.9  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  24.56 
 
 		 1546 aa  63.9  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  24.93 
 
 		 1742 aa  58.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  26.54 
 
 		 2110 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  30.94 
 
 		 277 aa  47.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  26.07 
 
 		 1012 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>