53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5101 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  100 
 
 
304 aa  609  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  30.77 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  31.54 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  35.04 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  33.06 
 
 
262 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  31.37 
 
 
258 aa  132  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  32.55 
 
 
261 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  32.2 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  34.07 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  32.26 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  31.3 
 
 
288 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  30.63 
 
 
274 aa  129  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  32.83 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  32.49 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  34.67 
 
 
312 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  32.08 
 
 
315 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  28.78 
 
 
276 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  31.05 
 
 
278 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  29.2 
 
 
274 aa  123  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  29.6 
 
 
281 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  34.85 
 
 
268 aa  119  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  31.17 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  30.23 
 
 
290 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  31.91 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  29.41 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  30.16 
 
 
290 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  33.48 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  25.48 
 
 
282 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  33.98 
 
 
269 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  30.43 
 
 
280 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  27.54 
 
 
284 aa  108  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  30.65 
 
 
274 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  28.85 
 
 
280 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  30.43 
 
 
295 aa  106  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  33.18 
 
 
277 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  28.52 
 
 
718 aa  98.2  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  30.56 
 
 
282 aa  95.9  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  30.52 
 
 
272 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  26.14 
 
 
415 aa  92  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  26.75 
 
 
1701 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  27.55 
 
 
289 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  23.23 
 
 
938 aa  77  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  24.43 
 
 
1012 aa  74.3  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  24.79 
 
 
469 aa  70.5  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  26.92 
 
 
2028 aa  59.7  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  18.9 
 
 
1546 aa  59.3  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  23.43 
 
 
1742 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15329  predicted protein  21.1 
 
 
533 aa  49.3  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  23.72 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  24 
 
 
325 aa  47  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  25.44 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  22.73 
 
 
310 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  24.56 
 
 
256 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>