39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND03320 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  100 
 
 
2028 aa  4180    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  34.17 
 
 
2110 aa  1007    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51869  calcium channel protein  32.73 
 
 
2206 aa  784    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.56529 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  23.31 
 
 
1701 aa  290  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  25.46 
 
 
1546 aa  191  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  24.53 
 
 
938 aa  173  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  24.24 
 
 
1742 aa  126  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  29.13 
 
 
278 aa  89  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  25.94 
 
 
256 aa  81.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  27.56 
 
 
315 aa  69.7  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  25 
 
 
281 aa  68.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  27.7 
 
 
274 aa  65.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  27.01 
 
 
291 aa  63.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  23.81 
 
 
274 aa  63.2  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  27.49 
 
 
282 aa  63.2  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  25.81 
 
 
274 aa  61.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  24.31 
 
 
328 aa  60.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  23.53 
 
 
290 aa  59.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  25.97 
 
 
304 aa  59.3  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  27.14 
 
 
282 aa  58.9  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  25.2 
 
 
415 aa  58.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  22.7 
 
 
271 aa  57.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  25.95 
 
 
288 aa  57  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  23.31 
 
 
276 aa  57.4  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  22.82 
 
 
258 aa  54.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  25.54 
 
 
292 aa  53.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  25.12 
 
 
273 aa  53.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  27.03 
 
 
284 aa  52.8  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  25 
 
 
278 aa  52.4  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  27.17 
 
 
295 aa  50.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  29.44 
 
 
269 aa  51.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  22.44 
 
 
262 aa  49.7  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  24.51 
 
 
276 aa  48.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  26.43 
 
 
282 aa  48.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  26.39 
 
 
277 aa  46.6  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  28.07 
 
 
272 aa  46.6  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  28.26 
 
 
312 aa  46.2  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  24.26 
 
 
268 aa  45.8  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  25.41 
 
 
274 aa  45.8  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>