51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2044 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  100 
 
 		 292 aa  576  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  61.72 
 
 		 258 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  59.14 
 
 		 261 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  59.3 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  60.9 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  60.25 
 
 		 261 aa  291  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  56.54 
 
 		 295 aa  289  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  59.07 
 
 		 277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  53.73 
 
 		 288 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  55.02 
 
 		 274 aa  269  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  49.12 
 
 		 271 aa  269  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  50.88 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  51.07 
 
 		 272 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  50 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  48.35 
 
 		 278 aa  250  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  51.92 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  49.65 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  50.72 
 
 		 289 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  51.42 
 
 		 300 aa  244  9e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  50.21 
 
 		 278 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  54.27 
 
 		 290 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  51.71 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  40.57 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  46.24 
 
 		 269 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  44.88 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  44.29 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  35.31 
 
 		 415 aa  166  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  32.62 
 
 		 276 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  35.53 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  33.94 
 
 		 291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  32.53 
 
 		 273 aa  155  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  35.9 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  33.7 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  32.32 
 
 		 276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  31.14 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  33.21 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  31.8 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  32.93 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  32.16 
 
 		 718 aa  123  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  37.08 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  38.67 
 
 		 469 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  29.63 
 
 		 1701 aa  105  7e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  28.52 
 
 		 938 aa  83.2  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  25.37 
 
 		 1012 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  27.27 
 
 		 1742 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  25.47 
 
 		 2028 aa  60.1  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  25.11 
 
 		 2110 aa  59.3  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  25.89 
 
 		 1546 aa  56.6  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  26.71 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51869  calcium channel protein  21.05 
 
 		 2206 aa  53.1  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.56529 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15329  predicted protein  22.47 
 
 		 533 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>