56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4024 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  100 
 
 		 282 aa  565  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  90.53 
 
 		 291 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  85.46 
 
 		 274 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  64.84 
 
 		 274 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  57.89 
 
 		 273 aa  318  7e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  57.74 
 
 		 276 aa  315  6e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  53.11 
 
 		 274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  51.96 
 
 		 276 aa  271  7e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  53.87 
 
 		 282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  51.67 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  32.97 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  33.92 
 
 		 271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  34.2 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  36.56 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  34.7 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  30.55 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  35.95 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  33.56 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  33.46 
 
 		 274 aa  139  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  32.23 
 
 		 261 aa  139  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  33.61 
 
 		 278 aa  138  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  34.72 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  35.8 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  34.34 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  32.61 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  34.84 
 
 		 277 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  34.16 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  29.86 
 
 		 290 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  31.5 
 
 		 312 aa  125  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  31.29 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  31.5 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  32.94 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  29.96 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  28.11 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  29.64 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  29.35 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  28 
 
 		 1701 aa  105  7e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  28.52 
 
 		 415 aa  104  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  29.34 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  28.95 
 
 		 282 aa  92.8  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  29.39 
 
 		 718 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  25.7 
 
 		 938 aa  90.5  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  24.21 
 
 		 1546 aa  80.9  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  26.11 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  23.74 
 
 		 1742 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  22.11 
 
 		 1012 aa  70.1  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  27.07 
 
 		 2028 aa  63.9  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51869  calcium channel protein  24.75 
 
 		 2206 aa  53.1  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.56529 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  27.81 
 
 		 256 aa  53.1  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  33.01 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  28.38 
 
 		 299 aa  45.8  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  29.79 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  27.19 
 
 		 240 aa  42.7  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  29.67 
 
 		 277 aa  42.7  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  31.18 
 
 		 279 aa  42.7  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  31.76 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>