52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1575 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  100 
 
 
268 aa  527  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  57.66 
 
 
261 aa  293  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  60.15 
 
 
292 aa  292  5e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  52.63 
 
 
262 aa  289  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  53.88 
 
 
261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  57.5 
 
 
258 aa  278  8e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  55.65 
 
 
271 aa  273  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  54.34 
 
 
295 aa  271  6e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  56.15 
 
 
281 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  55.84 
 
 
274 aa  269  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  52.04 
 
 
278 aa  268  8.999999999999999e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  58.15 
 
 
277 aa  259  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  54.51 
 
 
288 aa  256  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  55.56 
 
 
290 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  51.35 
 
 
289 aa  252  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  52.59 
 
 
290 aa  251  7e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  56.08 
 
 
272 aa  245  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  53.42 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  49.06 
 
 
278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  51.18 
 
 
280 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  51.57 
 
 
280 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  51.55 
 
 
300 aa  228  7e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  51.17 
 
 
269 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  42.86 
 
 
315 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  42.91 
 
 
282 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  40.78 
 
 
312 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  34.75 
 
 
276 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  36.09 
 
 
415 aa  157  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  33.82 
 
 
282 aa  149  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  33.21 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  33.33 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  33.85 
 
 
274 aa  143  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  34.75 
 
 
274 aa  142  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  36.32 
 
 
291 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  31.37 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  40.71 
 
 
718 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  34.85 
 
 
304 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  33.33 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  39.93 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  31.8 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  31.28 
 
 
469 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  31.27 
 
 
1701 aa  106  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  30.2 
 
 
938 aa  86.3  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  24.28 
 
 
1742 aa  71.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  24.49 
 
 
1546 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  28.57 
 
 
1012 aa  62.8  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  21.91 
 
 
2110 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  24.79 
 
 
2028 aa  53.9  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  29.94 
 
 
256 aa  52.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51869  calcium channel protein  22.13 
 
 
2206 aa  47.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.56529 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  23.71 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15329  predicted protein  23.33 
 
 
533 aa  42.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>