54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1880 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  100 
 
 		 328 aa  646    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  64.64 
 
 		 290 aa  325  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  60.63 
 
 		 281 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  48.89 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  50.91 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  50.58 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  42.44 
 
 		 274 aa  217  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  43.68 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  45.94 
 
 		 290 aa  215  7e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  46.03 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  43.97 
 
 		 261 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  46.03 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  37.24 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  46.59 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  45.16 
 
 		 278 aa  208  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  48.55 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  46.3 
 
 		 272 aa  205  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  44.78 
 
 		 258 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  46.04 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  46.21 
 
 		 277 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  45.35 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  44.96 
 
 		 280 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  39.85 
 
 		 271 aa  192  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  42.34 
 
 		 288 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  42.02 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  38.83 
 
 		 312 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  37.36 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  36.58 
 
 		 415 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  36.36 
 
 		 274 aa  152  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  32.52 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  36.56 
 
 		 282 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  32.58 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  36.12 
 
 		 282 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  33.47 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  32.58 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  32.81 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  32.06 
 
 		 284 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  31.68 
 
 		 718 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  35.68 
 
 		 469 aa  119  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  29.77 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  34.7 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  26.73 
 
 		 1701 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  27.56 
 
 		 938 aa  94  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  25.66 
 
 		 1546 aa  82.4  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  25.08 
 
 		 1742 aa  77.4  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  26.61 
 
 		 1012 aa  71.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  24.07 
 
 		 2028 aa  62.4  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  22.54 
 
 		 2110 aa  56.6  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15329  predicted protein  23.26 
 
 		 533 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  27.08 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  24.68 
 
 		 256 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  39.73 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51869  calcium channel protein  22.51 
 
 		 2206 aa  43.9  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.56529 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  22.83 
 
 		 282 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>