53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2617 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  100 
 
 		 272 aa  541  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  64.35 
 
 		 277 aa  276  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  50.38 
 
 		 258 aa  275  6e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  49.42 
 
 		 262 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  51.07 
 
 		 292 aa  266  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  48.44 
 
 		 261 aa  265  8e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  52.35 
 
 		 290 aa  258  9e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  54.62 
 
 		 289 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  56.08 
 
 		 268 aa  256  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  48.21 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  46.84 
 
 		 274 aa  249  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  48.72 
 
 		 288 aa  249  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  52.49 
 
 		 295 aa  248  7e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  51 
 
 		 281 aa  244  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  48.67 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  47.53 
 
 		 280 aa  228  7e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  48.89 
 
 		 300 aa  227  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  48.28 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  46.85 
 
 		 271 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  47.06 
 
 		 278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  45.9 
 
 		 328 aa  218  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  42.69 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  47.49 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  46.89 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  42.47 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  37.45 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  34.63 
 
 		 415 aa  149  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  33.09 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  29.96 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  30.27 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  29.1 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  29.48 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  32.56 
 
 		 274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  30.11 
 
 		 291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  35.82 
 
 		 282 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  31.5 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  31.87 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  36.96 
 
 		 718 aa  122  8e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  34.42 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  34.63 
 
 		 469 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  30.52 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  27.17 
 
 		 1701 aa  95.1  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  28.64 
 
 		 938 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  27.31 
 
 		 1012 aa  60.1  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  23.79 
 
 		 1546 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  22.79 
 
 		 2110 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  26.15 
 
 		 2028 aa  53.9  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.24 
 
 		 409 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  22.86 
 
 		 1742 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  22.71 
 
 		 419 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  24.43 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15329  predicted protein  21.01 
 
 		 533 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  25.21 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>