59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4165 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  100 
 
 
276 aa  558  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  58.94 
 
 
273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  59.14 
 
 
274 aa  322  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  59.53 
 
 
274 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  57.74 
 
 
282 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  55.93 
 
 
291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  50.87 
 
 
284 aa  281  6.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  52.69 
 
 
274 aa  276  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  51.55 
 
 
276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  52 
 
 
282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  39.83 
 
 
328 aa  165  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  34.41 
 
 
278 aa  158  8e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  34.19 
 
 
288 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  34.4 
 
 
290 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  32.3 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  30.74 
 
 
315 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  32.36 
 
 
274 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  33.2 
 
 
278 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  34.36 
 
 
268 aa  149  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  32.18 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  33.87 
 
 
261 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  34.27 
 
 
271 aa  141  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  32.83 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  32.39 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  32.47 
 
 
300 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  34.96 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  31.46 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  30.03 
 
 
289 aa  132  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  32.92 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  32.64 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  28.78 
 
 
304 aa  125  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  32.71 
 
 
280 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  32.69 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  33.09 
 
 
272 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  31.03 
 
 
290 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  31.34 
 
 
277 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  31.51 
 
 
415 aa  108  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  33.63 
 
 
282 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  30.58 
 
 
277 aa  102  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  29.2 
 
 
718 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  26.52 
 
 
1701 aa  89.7  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  27.17 
 
 
938 aa  89  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  30.53 
 
 
469 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  26.92 
 
 
1546 aa  71.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  22.1 
 
 
1742 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  27.12 
 
 
1012 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  24.24 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  24.83 
 
 
2110 aa  50.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  23.72 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  23.72 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  23.72 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  24.53 
 
 
2028 aa  46.2  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  24.09 
 
 
274 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51869  calcium channel protein  24.12 
 
 
2206 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.56529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  25 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  32.04 
 
 
240 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  23.21 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  29.13 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  29.21 
 
 
276 aa  42.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>