35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_51869 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  33.49 
 
 		 2110 aa  1040    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51869  calcium channel protein  100 
 
 		 2206 aa  4567    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.56529 
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  32.89 
 
 		 2028 aa  813    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  22.61 
 
 		 1701 aa  264  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  26.06 
 
 		 1546 aa  187  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  22.35 
 
 		 1742 aa  105  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  22.4 
 
 		 938 aa  100  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  22.61 
 
 		 278 aa  58.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  22.69 
 
 		 288 aa  57.4  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  24.74 
 
 		 315 aa  55.5  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  20.1 
 
 		 415 aa  55.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  26.72 
 
 		 290 aa  52.8  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  24.75 
 
 		 282 aa  52.8  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  23.29 
 
 		 274 aa  52.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  24.75 
 
 		 274 aa  52.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  24.5 
 
 		 272 aa  51.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  23.9 
 
 		 273 aa  51.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  23.27 
 
 		 290 aa  50.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  22.98 
 
 		 276 aa  50.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  24 
 
 		 271 aa  50.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  17.95 
 
 		 281 aa  49.3  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  22.01 
 
 		 278 aa  48.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  22.33 
 
 		 328 aa  47.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  21.93 
 
 		 268 aa  47.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  19.59 
 
 		 292 aa  47  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  28.26 
 
 		 278 aa  47.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  28.26 
 
 		 278 aa  47.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  25.35 
 
 		 469 aa  47  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  21.21 
 
 		 274 aa  46.6  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  28.26 
 
 		 278 aa  46.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  28.26 
 
 		 278 aa  46.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  28.26 
 
 		 278 aa  46.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  20 
 
 		 262 aa  45.8  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  21.71 
 
 		 282 aa  46.2  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  26.81 
 
 		 288 aa  45.8  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>