62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4775 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  100 
 
 		 271 aa  545  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  55.65 
 
 		 268 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  46.93 
 
 		 274 aa  248  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  53.07 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  49.22 
 
 		 258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  44.74 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  49.12 
 
 		 292 aa  238  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  49.36 
 
 		 261 aa  237  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  46.18 
 
 		 278 aa  231  7.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  46.62 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  53.36 
 
 		 277 aa  225  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  48.86 
 
 		 295 aa  222  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  43.59 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  38.66 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  45.15 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  44.13 
 
 		 280 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  45.22 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  45.19 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  46.85 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  46.72 
 
 		 280 aa  195  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  45.96 
 
 		 290 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  42.68 
 
 		 328 aa  188  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  34.94 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  41.39 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  35.27 
 
 		 415 aa  150  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  33.21 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  37.5 
 
 		 312 aa  149  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  42.17 
 
 		 282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  33.22 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  34.63 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  32.97 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  30.88 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  34.27 
 
 		 276 aa  141  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  32.84 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  33.82 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  34.78 
 
 		 284 aa  135  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  34.88 
 
 		 718 aa  133  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  36.18 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  35.09 
 
 		 469 aa  113  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  29.04 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  26.79 
 
 		 1701 aa  93.6  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  32.24 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  27.47 
 
 		 938 aa  82.8  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  23.68 
 
 		 2110 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  25.61 
 
 		 1546 aa  59.3  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  23.53 
 
 		 1742 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  27.76 
 
 		 1012 aa  57  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  24.89 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  22.7 
 
 		 2028 aa  52  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51869  calcium channel protein  24 
 
 		 2206 aa  50.4  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.56529 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  27.45 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  25.6 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  31.03 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  31.03 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  31.03 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  29.31 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  31.03 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  26.36 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  25.78 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  28.45 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  28.45 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  28.45 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>