44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_13647 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  100 
 
 
1546 aa  3167    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  27.68 
 
 
1701 aa  259  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  27.15 
 
 
938 aa  232  5e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51869  calcium channel protein  26.06 
 
 
2206 aa  187  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.56529 
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  25.46 
 
 
2028 aa  182  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  24.42 
 
 
2110 aa  165  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  25.04 
 
 
1742 aa  162  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  27.27 
 
 
256 aa  89  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  27.71 
 
 
273 aa  83.2  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  25.66 
 
 
328 aa  81.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  25.6 
 
 
274 aa  80.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  24.21 
 
 
282 aa  80.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  25.49 
 
 
274 aa  79  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  24.5 
 
 
291 aa  77.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  26.03 
 
 
276 aa  75.1  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  25.38 
 
 
274 aa  74.3  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  26.7 
 
 
278 aa  73.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  28.64 
 
 
282 aa  72.4  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  26.92 
 
 
276 aa  71.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  25.99 
 
 
290 aa  70.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  24.9 
 
 
315 aa  70.5  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  28.95 
 
 
284 aa  67  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  31.95 
 
 
277 aa  65.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  23.46 
 
 
278 aa  63.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  24.61 
 
 
415 aa  63.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  27.38 
 
 
281 aa  63.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  24.09 
 
 
274 aa  62  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  28.94 
 
 
312 aa  62  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  26.02 
 
 
288 aa  60.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  25.61 
 
 
271 aa  59.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  28.57 
 
 
304 aa  59.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  27.07 
 
 
269 aa  59.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  22.97 
 
 
1012 aa  59.3  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  26.11 
 
 
290 aa  57.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  24.49 
 
 
268 aa  57.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  22.91 
 
 
300 aa  57.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  24.42 
 
 
295 aa  57.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  25.39 
 
 
280 aa  56.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  24.24 
 
 
469 aa  52.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  30.34 
 
 
258 aa  52.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  25.68 
 
 
272 aa  50.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  24.61 
 
 
280 aa  48.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  24.09 
 
 
718 aa  48.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  23.65 
 
 
262 aa  45.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>