45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_43828 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  100 
 
 		 718 aa  1473    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  43.86 
 
 		 415 aa  286  1.0000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  54.74 
 
 		 469 aa  250  7e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  37.14 
 
 		 278 aa  140  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  35.95 
 
 		 281 aa  133  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  34.88 
 
 		 271 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  35.97 
 
 		 278 aa  127  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  37.4 
 
 		 290 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  30.63 
 
 		 288 aa  122  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  35.78 
 
 		 328 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  40.71 
 
 		 268 aa  118  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  30.97 
 
 		 274 aa  117  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  29.02 
 
 		 273 aa  114  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  32.41 
 
 		 258 aa  111  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  35.06 
 
 		 261 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  34.25 
 
 		 280 aa  107  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  33.62 
 
 		 262 aa  107  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  33.65 
 
 		 261 aa  107  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  34.64 
 
 		 280 aa  105  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  29.37 
 
 		 290 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  30.34 
 
 		 274 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  34.18 
 
 		 272 aa  102  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  29.2 
 
 		 276 aa  100  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  37.05 
 
 		 292 aa  99.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  31.72 
 
 		 300 aa  99.8  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  28.52 
 
 		 304 aa  95.5  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  26.79 
 
 		 315 aa  94.7  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  34.39 
 
 		 277 aa  94.7  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  28.46 
 
 		 276 aa  93.2  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  32.03 
 
 		 295 aa  92  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  31.25 
 
 		 289 aa  89  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  29.78 
 
 		 282 aa  88.2  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  29.33 
 
 		 291 aa  88.2  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  28.24 
 
 		 312 aa  87.8  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  27.97 
 
 		 1701 aa  86.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  33.63 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  28.82 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  26.44 
 
 		 282 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  31.94 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  24.9 
 
 		 284 aa  79.3  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  26.18 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  25.69 
 
 		 938 aa  60.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  23.32 
 
 		 1742 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  24.09 
 
 		 1546 aa  48.9  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  27.24 
 
 		 277 aa  48.5  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0277523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>