51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0915 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  100 
 
 
278 aa  554  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  52.04 
 
 
268 aa  255  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  48.44 
 
 
288 aa  242  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  45.85 
 
 
261 aa  239  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  46.18 
 
 
271 aa  231  7.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  46.77 
 
 
262 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  47.29 
 
 
292 aa  225  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  46.48 
 
 
281 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  44.31 
 
 
261 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  48.67 
 
 
258 aa  222  7e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  43.4 
 
 
274 aa  215  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  42.09 
 
 
278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  47.43 
 
 
280 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  47.04 
 
 
280 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  44.49 
 
 
290 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  47.21 
 
 
277 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  45.56 
 
 
300 aa  206  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  42.07 
 
 
295 aa  203  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  47.11 
 
 
328 aa  201  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  46.27 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  42.91 
 
 
289 aa  195  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  36.23 
 
 
315 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  42.29 
 
 
272 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  39.16 
 
 
312 aa  170  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  44.69 
 
 
282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  39.47 
 
 
269 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  34.41 
 
 
276 aa  158  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  32.03 
 
 
291 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  38.2 
 
 
415 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  33.83 
 
 
274 aa  152  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  33.33 
 
 
273 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  31.5 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  33.2 
 
 
276 aa  146  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  31.91 
 
 
274 aa  145  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  31.95 
 
 
282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  31.8 
 
 
274 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  35.97 
 
 
718 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  31.05 
 
 
304 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  31.9 
 
 
277 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  30.71 
 
 
284 aa  122  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  37.43 
 
 
469 aa  115  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  28.74 
 
 
1701 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  27.78 
 
 
938 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  23.46 
 
 
1546 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  28.31 
 
 
1742 aa  60.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  18.79 
 
 
1012 aa  56.2  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  24.29 
 
 
2110 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  25.89 
 
 
2028 aa  48.9  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15329  predicted protein  24 
 
 
533 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  27.85 
 
 
265 aa  43.5  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51869  calcium channel protein  21.76 
 
 
2206 aa  43.5  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.56529 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>