54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1920 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  100 
 
 		 290 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  60.69 
 
 		 280 aa  301  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  60.46 
 
 		 280 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  54.44 
 
 		 295 aa  276  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  49.81 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  53.49 
 
 		 288 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  57.08 
 
 		 277 aa  259  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  52.77 
 
 		 289 aa  258  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  50.18 
 
 		 292 aa  258  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  49.61 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  55.02 
 
 		 258 aa  256  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  51.99 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  52.96 
 
 		 268 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  48.48 
 
 		 274 aa  248  9e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  46.51 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  49.07 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  49.05 
 
 		 300 aa  224  9e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  46.18 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  46.67 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  45.56 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  45.23 
 
 		 290 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  47 
 
 		 328 aa  205  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  39.41 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  45.65 
 
 		 269 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  38.71 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  43.53 
 
 		 282 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  33.69 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  32.39 
 
 		 284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  33.33 
 
 		 276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  32.18 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  31.05 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  31.29 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  33.75 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  31.06 
 
 		 415 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  33.69 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  32.64 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  35.53 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  30.1 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  30.95 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  30.07 
 
 		 718 aa  114  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  27.03 
 
 		 469 aa  96.7  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  28.51 
 
 		 1701 aa  93.6  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  26.55 
 
 		 1546 aa  70.5  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  23.76 
 
 		 1012 aa  66.2  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  24.18 
 
 		 938 aa  66.2  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  21.05 
 
 		 1742 aa  57.4  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  26.29 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51869  calcium channel protein  23.27 
 
 		 2206 aa  53.5  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.56529 
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  25.23 
 
 		 2028 aa  53.5  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  30.61 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  32.98 
 
 		 256 aa  49.3  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15329  predicted protein  20.77 
 
 		 533 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  23.44 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  22.13 
 
 		 2110 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>