72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03691 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  100 
 
 
284 aa  569  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  72.89 
 
 
282 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  59.86 
 
 
274 aa  310  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  55.07 
 
 
276 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  50.87 
 
 
276 aa  298  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  56.17 
 
 
274 aa  284  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  51.12 
 
 
274 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  51.67 
 
 
282 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  56.22 
 
 
291 aa  269  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  50.38 
 
 
273 aa  268  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  33.21 
 
 
315 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  34.78 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  36.59 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  34.31 
 
 
258 aa  145  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  33.46 
 
 
288 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  37.25 
 
 
261 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  31.84 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  31.84 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  32.62 
 
 
328 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  30.71 
 
 
278 aa  133  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  34.07 
 
 
300 aa  133  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  32.04 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  30.57 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  34.69 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  31.35 
 
 
281 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  33.33 
 
 
268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  33.81 
 
 
312 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  31.52 
 
 
290 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  32.42 
 
 
295 aa  125  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  27.88 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  32.34 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  29.37 
 
 
280 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  31.14 
 
 
272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  33.2 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  30.45 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  32.02 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  30.58 
 
 
277 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  28.87 
 
 
277 aa  99  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  26.67 
 
 
415 aa  93.6  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  24.9 
 
 
718 aa  90.5  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  24.89 
 
 
938 aa  79.3  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  25.63 
 
 
1701 aa  78.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  21.86 
 
 
1012 aa  72.8  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  28.85 
 
 
469 aa  69.7  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  28.95 
 
 
1546 aa  67  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  28.57 
 
 
1742 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  25.21 
 
 
2028 aa  57  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  21.8 
 
 
2110 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15329  predicted protein  20.07 
 
 
533 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  28.57 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  27.78 
 
 
289 aa  47  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  28.57 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  28.57 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  28.57 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  30.41 
 
 
240 aa  46.6  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  24.49 
 
 
256 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  26.98 
 
 
289 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  26.98 
 
 
289 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  23.08 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  23.08 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  23.08 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  24.44 
 
 
279 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  26.98 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  30.34 
 
 
273 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  23.92 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  22.1 
 
 
276 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  23.85 
 
 
276 aa  43.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  30.19 
 
 
288 aa  43.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  29.21 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  29.21 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  26.57 
 
 
295 aa  42.7  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  25.2 
 
 
279 aa  42.4  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>