50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_16877 on replicon NC_009363
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  100 
 
 		 1012 aa  2082    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  34.63 
 
 		 277 aa  107  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  29.71 
 
 		 288 aa  102  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  33.69 
 
 		 282 aa  99.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  22.76 
 
 		 938 aa  96.3  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  30.98 
 
 		 284 aa  96.3  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  34.52 
 
 		 276 aa  91.3  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  28.57 
 
 		 273 aa  88.2  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  26.74 
 
 		 315 aa  87.4  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  27.78 
 
 		 276 aa  86.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  37.78 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  27.34 
 
 		 274 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  34.29 
 
 		 274 aa  85.5  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  37.04 
 
 		 282 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  28.44 
 
 		 274 aa  82.8  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  26.78 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  23.15 
 
 		 1701 aa  80.9  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  27.76 
 
 		 271 aa  80.1  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  34.07 
 
 		 274 aa  79.3  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  25.94 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  27.56 
 
 		 262 aa  77  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  27.4 
 
 		 300 aa  75.9  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  28.15 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  24.43 
 
 		 304 aa  73.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  27.17 
 
 		 258 aa  73.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  28.57 
 
 		 328 aa  73.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  26.8 
 
 		 290 aa  72.8  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  26.64 
 
 		 261 aa  72.4  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  26.96 
 
 		 261 aa  70.9  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  24.91 
 
 		 290 aa  67.4  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  26.04 
 
 		 278 aa  67.8  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  27.63 
 
 		 280 aa  65.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  20.89 
 
 		 1742 aa  63.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  24.4 
 
 		 289 aa  63.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  26.07 
 
 		 280 aa  62  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  21.92 
 
 		 269 aa  59.3  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  23.05 
 
 		 1546 aa  58.9  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  25.45 
 
 		 718 aa  58.5  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  22.52 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  23.95 
 
 		 272 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  27.27 
 
 		 312 aa  55.5  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  23.16 
 
 		 278 aa  55.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  23.55 
 
 		 415 aa  54.3  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  22.6 
 
 		 278 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  22.6 
 
 		 278 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  22.6 
 
 		 278 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  27.21 
 
 		 2028 aa  53.5  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  22.6 
 
 		 278 aa  52  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  26.42 
 
 		 469 aa  50.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  24.25 
 
 		 277 aa  45.8  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>