52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3349 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  100 
 
 		 274 aa  546  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  84.75 
 
 		 282 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  81.75 
 
 		 291 aa  476  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  65.41 
 
 		 274 aa  360  1e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  60.7 
 
 		 273 aa  325  5e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  59.53 
 
 		 276 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  54.9 
 
 		 274 aa  272  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  50 
 
 		 276 aa  267  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  49.81 
 
 		 282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  51.12 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  33.83 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  33.21 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  36.73 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  34.93 
 
 		 328 aa  142  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  29.85 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  33.21 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  35.63 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  32.22 
 
 		 278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  35.04 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  36.21 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  33.85 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  32.8 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  32.58 
 
 		 281 aa  132  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  34.84 
 
 		 261 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  36.23 
 
 		 277 aa  125  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  34.3 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  31.95 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  30.8 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  31.85 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  30.34 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  30.19 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  29.71 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  29.41 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  29.09 
 
 		 415 aa  106  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  32.17 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  29.04 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  29.03 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  28.36 
 
 		 1701 aa  100  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  31.17 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  30.53 
 
 		 282 aa  92.8  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  25.87 
 
 		 938 aa  87  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  28.82 
 
 		 718 aa  85.9  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  25.49 
 
 		 1546 aa  79  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  26.99 
 
 		 469 aa  75.5  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  21.43 
 
 		 1012 aa  68.9  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  22.99 
 
 		 1742 aa  68.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  27.7 
 
 		 2028 aa  65.5  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51869  calcium channel protein  24.75 
 
 		 2206 aa  52.8  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.56529 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  27.15 
 
 		 256 aa  49.3  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  30.1 
 
 		 288 aa  48.9  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  28 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  29.77 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>