57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2848 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  100 
 
 		 261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  76.49 
 
 		 262 aa  393  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  70.93 
 
 		 261 aa  368  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  72.8 
 
 		 258 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  51.92 
 
 		 274 aa  276  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  57.66 
 
 		 268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  64.15 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  50 
 
 		 277 aa  246  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  49.2 
 
 		 288 aa  245  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  53.07 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  48.84 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  47.15 
 
 		 281 aa  236  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  55.19 
 
 		 295 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  50.4 
 
 		 290 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  48.21 
 
 		 272 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  44.31 
 
 		 278 aa  223  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  46.43 
 
 		 280 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  48.23 
 
 		 289 aa  215  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  46.03 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  45.63 
 
 		 280 aa  211  9e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  47.35 
 
 		 300 aa  210  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  40.39 
 
 		 278 aa  208  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  46.49 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  38.53 
 
 		 315 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  45.95 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  38.19 
 
 		 312 aa  158  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  34 
 
 		 273 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  33.87 
 
 		 276 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  32.77 
 
 		 276 aa  139  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  35.29 
 
 		 274 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  33.59 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  37.25 
 
 		 284 aa  131  9e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  32.2 
 
 		 304 aa  131  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  35.29 
 
 		 282 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  34.84 
 
 		 274 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  34.67 
 
 		 282 aa  125  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  34.22 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  30.4 
 
 		 415 aa  122  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  36.54 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  35.5 
 
 		 718 aa  109  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  34.08 
 
 		 469 aa  97.1  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  28.17 
 
 		 1701 aa  92.4  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  29.29 
 
 		 938 aa  66.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  27.23 
 
 		 1742 aa  54.7  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  23.3 
 
 		 1012 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  31.13 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  24.63 
 
 		 289 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  25.99 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  21.72 
 
 		 2028 aa  43.9  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  28.35 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  24.63 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  27.72 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.17 
 
 		 409 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  24.43 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  19.67 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  20.99 
 
 		 2110 aa  42.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  20.92 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>